解旋酶Sen1行走机制的研究

时间:2023-01-08 01:47:26
作者:张悦悦,韩伟静,陈同生,王爽
关键字:Sen1解旋酶, 行走, 单分子荧光共振能量转移, 转录终止
DOI:10.7498/aps.72.20230187
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转录终止是调节基因转录过程的重要步骤, 关系到基因表达调控过程的正常进行和基因组的稳定性. 酵母体系中, Sen1是一种解旋酶, 通过水解腺苷三磷酸(adenosine triphosphate, ATP)获得能量来行使在核酸底物上的一维运动, 进而实现转录终止功能. 然而, Sen1的这种运动机制与转录终止功能的关联, 目前尚未清晰的表征. 本文应用凝胶电泳迁移方法表征Sen1解旋双链DNA和结合单链DNA的能力, 并且发现单个Sen1分子能够结合≤ 24 nt (nucleotide, nt)的单链DNA; 进一步, 在提供ATP的条件下, 应用单分子荧光共振能量转移技术表征了Sen1在单链DNA上的行走功能, 其行走速率随ATP浓度变化而变化, 符合经典米氏动力学模型; 考虑单链DNA底物的长度, 可以估算出Sen1的行走速率约为70 nt/s. 这些研究结果定量表征了Sen1的行走速率, 为理解真核转录终止机制提供了分子马达运动方面的实验数据.

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