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DNA 分子是生命遗传信息的主要物质载体。DNA 环化是DNA 不同位置所携带信息的一种协同实现方式。典型的例子是转录调控，增强子通过DNA 环化与启动子相互作用，从而实现了对基因表达水平的调控。因此，破译DNA 的环化动力学是解读基础生命过程的重要课题。本文在介绍DNA 结构和力学性质的基础上，综述DNA 环化时间的计算方法。在生理条件下，DNA 的主要性质特点是弯折柔性强，而扭转和拉伸刚性强；据此，DNA 环化可视作自发的熵减过程。运用热力学统计理论，可获得计算DNA 环化时间的半经验公式。公式中的参数可由单分子光谱共聚焦技术测得的数据确定。该公式表明，空间拓扑决定了环化概率，DNA 长度决定了环化时间。该公式适用于计算DNA 上的顺式元件之间、顺式元件与启动子之间的相互作用。其优点在于避开了DNA 结构和细胞核环境的复杂性。

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《DNA 环化时间的半经验计算方法》

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