大豆GmCOL1和GmCOL13启动子和基因组基因的克隆与生物信息学分析

时间:2022-10-10 01:51:24
作者:韩英英,陈福禄,傅永福,张晓玫
关键字:大豆,GmCOL,GmCOL,基因克隆,生物信息学分析
DOI:10.13560/J.cnki.biotech.bull.1985.2017-0201
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摘要: 以大豆天隆1号为材料提取基因组DNA,分别克隆到长2 631 bp的 GmCOL1启动子和2 809 bp的GmCOL13启动子。此外,还克隆到GmCOL1和GmCOL13基因组基因长度分别为3 488 bp和2 798 bp,它们分别编码含348个和366个氨基酸的蛋白质。利用PlantCARE分析GmCOL1和GmCOL13的启动子序列发现,它们均含有以下调控元件:生物钟元件(Circadian)、光响应元件(ACEG-box等)、ABA响应元件(ABRE)、干旱诱导元件(MBS)、低温响应元件(LTR)。ProtParam分析表明,GmCOL1和GmCOL13蛋白质的分子量分别为38.47 kD和40.91 kD,并且都是亲水性蛋白。GOR分析显示,GmCOL1和GmCOL13的二级结构含有Alpha helix,Extended strand和Random coil。在线网站PROSITE的分析说明,GmCOL1和GmCOL13有两个Zinc finger B-box和一个CCT domain(CO,CO-LIKE and TOC1 domain)结构域。

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大豆GmCOL1和GmCOL13启动子和基因组基因的克隆与生物信息学分析
《大豆GmCOL1和GmCOL13启动子和基因组基因的克隆与生物信息学分析》
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文件号:224774
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