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夏蜡梅Sinocalycanthus chinensis是中国二级濒危植物。为了开发基于夏蜡梅转录组序列的表达序列标签SSR（EST-SSRs）引物，从夏蜡梅转录组数据库组装的125 014条unigene序列中检测到26 564个简单重复序列（SSRs），平均密度为5.18 kb，最丰富的类型是2碱基重复、单碱基重复和3碱基重复，分别占总SSRs的42.43%，29.50%和23.25%，其中主导类型是（AG/CT）n。利用L16（45）正交试验获得夏蜡梅的最优简单重复序列-聚合酶链式反应（SSR-PCR）体系：20.0 μL含Taq酶0.6 U（1 U=16.67 nkat），镁离子（Mg2+）1.50 mmol·L-1，三磷酸碱基脱氧核苷酸（dNTP）0.25 mmol·L-1，引物0.20 μmol·L-1，DNA 75 ng。针对所有EST-SSRs共设计出15 585对符合要求的引物，随机选择了220对进行聚合酶链式反应（PCR）扩增，其中120对（54.55%）成功扩增出产物，14对在不同种群个体中扩增出多态，平均扩增等位基因数为2.64，7对在同一种群个体中扩增出多态。这些多态引物的开发可为夏蜡梅的遗传分析提供更丰富的标记。

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《基于转录组序列的夏蜡梅SSR位点特征与引物开发》

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文件号：106038

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