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叶绿体基因组为母系遗传，保守性高，因此叶绿体基因组中的简单序列重复（SSR）标记可在更高分类水平上进行种质资源鉴定和群体遗传结构分析。利用TRF软件和SSR Hunter软件相结合对花椒Zanthoxylum bungeanum叶绿体基因组中的SSR位点进行筛选。结果显示：花椒叶绿体基因组中共有144个SSR位点，位点间的平均分布距离为1 100.00 bp。基于检测软件设置参数，SSR重复类型主要集中在一、三核苷酸重复，二者占SSR位点总数的91.67%。此外，随机设计合成30对SSR引物对10份花椒种质、5份竹叶花椒Zanthoxylum armatum种质和1份日本花椒Zanthoxylum piperitum种质进行PCR扩增检测，共筛选出10对多态性引物，其中单核苷酸重复位点的多态性高于多核苷酸重复位点。本研究开发的叶绿体SSR标记可有效区分花椒、竹叶花椒和日本花椒，但在花椒种内并未检测出多态性。表明花椒叶绿体基因组的SSR标记可用于花椒属Zanthoxylum不同种间的遗传多样性分析。

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《花椒cpSSR标记开发及在种间、种内的通用性分析》

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文件号：105706

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