窄叶鲜卑花(Sibiraea angustata)nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列分子进化特点的分析

时间:2022-07-15 18:04:51
作者:段义忠,张得钧,高庆波,张发起,李印虎,陈世龙*
关键字:窄叶鲜卑花,ITS 序列,trnL-F序列,trnS-G序列,rpl20-rps12序列
DOI:10.7525/j.issn.1673-5102.2010.02.004
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摘要: 应用PCR产物直接测序法分析了窄叶鲜卑花居群间nrDNA(核糖体DNA) ITS序列和cpDNA(叶绿体DNA)trnL-F的碱基差异,并与cpDNA trnS-G序列和rpl20-rps12序列进行比较,从而初步研究两套植物基因组的变异速率。采用改良的CTAB法从硅胶干燥的窄叶鲜卑花叶片中提取总DNA,并对nrDNA ITS和cpDNA trnL-F区域进行扩增、纯化、测序。nrDNA ITS序列共有601 bp,有变异位点3处,变异位点百分率为0.05%,(G+C)含量为41.4%。cpDNA trnL-F序列共有927 bp,有变异位点1处,变异位点百分率0.01%,(G+C)含量为32.6%,两种序列的核苷酸多样性非常低。比较发现,窄叶鲜卑花nrDNA ITS区域较cpDNA trnS-G序列和rpl20-rps12序列保守,变异速率较慢,比cpDNA trnL-F序列变异速率稍快。通过对ITS序列单倍型(haplotype)进行分析发现,窄叶鲜卑花现有分布范围经历了居群近期范围扩张,与叶绿体基因组(trnS-G和rpl20-rps12序列)得出的结论一致。因此,窄叶鲜卑花nrDNA ITS序列适合该种的谱系地理学研究。

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