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通过生物大分子计算平台对分子动力学的模拟运算，计算值可以描述分子的运动轨迹，从而揭示原子间的内在关系，但这一过程较为复杂且昂贵。作者研究了较低投入下大分子计算平台的构建与优化，在并行GPU条件和CUDA体系下使用AMBER软件包完成分子动力学的模拟运算。通过对两个大分子体系的运算，实验结果表明计算平台达到了60倍的计算加速，实现了较高的加速性能，完成了高性价比的高性能计算平台的建设。

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《基于GPU的生物大分子计算平台的构建与优化》

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文件号：307166

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