番茄JMJ524基因调控SlGLD1的DNA甲基化分析

时间:2023-09-16 18:41:11
作者:杨伟,潘宇,苏承刚,张兴国,李金华
关键字:JmjC,GLD,DNA甲基化,番茄
DOI:
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摘要: 旨在分析番茄JMJ524基因如何通过影响SlGLD1 的DNA甲基化程度来调控其表达,从而导致番茄的赤霉素不敏感的矮化。利用生物信息学和BSP(Bisulfite sequencing PCR)分析JMJ524抑制系和野生型的SlGLD1的DNA甲基化程度。结果显示,分离出SlGLD1的启动子序列,发现其启动子区域含有3个GA响应的顺式作用元件;SlGLD1的启动子区域和编码区的DNA是高度甲基化的,而且在不同组织部位和突变体中的甲基化模式是不一样的;在基因的编码区发现了两个GC岛,推测SlGLD1的甲基化可能发生在基因的编码区;针对这两个GC岛进行的BSP分析结果表明:SlGLD1的这两个区段的DNA CpG是高度甲基化的,而且在JMJ524抑制系中,DNA的整体甲基化,特别是CpG甲基化程度显著低于野生型对照M82。JMJ524抑制表达导致了SlGLD1的基因甲基化程度降低,从而激活这个基因的表达,可能是导致番茄植株矮化的一个因素。

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番茄JMJ524基因调控SlGLD1的DNA甲基化分析
《番茄JMJ524基因调控SlGLD1的DNA甲基化分析》
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