不同施肥处理农田土壤中噬菌体与细菌携带抗生素抗性基因的比较

时间:2022-08-26 21:41:50
作者:胡雪莹,张越,郭雅杰,仇天雷,高敏,孙兴滨,王旭明
关键字:抗生素抗性基因,噬菌体,农田土壤,微滴数字PCR,冗余分析
DOI:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2021-1544
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为了揭示有机肥和化肥长期施用对农田土壤噬菌体携带的抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)多样性和丰度的影响,并与土壤细菌携带的ARGs进行对比,本文将土壤抗生素抗性分为细菌和噬菌体两个部分,利用微滴数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)技术定量分析了土壤噬菌体和细菌DNA中25种ARGs亚型和I类整合子(intl1)的丰度。结果表明,土壤噬菌体中ARGs的检出率和总丰度以及intl1丰度均低于土壤细菌,其中噬菌体中检测到20种ARGs亚型,在不施肥、单施化肥和单施有机肥土壤的噬菌体中,目标ARGs的检出率分别为68%、72%和76%。土壤噬菌体中ARGs的总丰度在有机肥施用土壤中显著高于不施肥和化肥施用土壤(P

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