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摘要： 旨在调查四川地区藏猪戊型肝炎病毒（hepatitis E virus，HEV）的流行情况和遗传演化，作者用RT-PCR法对2018—2020年采集自四川省甘孜藏族自治州和阿坝藏族自治州的22个藏猪场332份藏猪粪便样本进行HEV检测，并对阳性样本进行基因分型。RT-PCR检测结果表明HEV核酸阳性率为20.48%（68/332，95% CI=16.3%~25.2%），22个规模藏猪场中HEV猪场阳性率为77.27%（17/22，95% CI=54.6%~92.2%），健康样本阳性率为2.86%（3/105，95% CI=0.6%~8.1%），腹泻样本阳性率为28.63%（65/227，95% CI=22.8%~35.0%），系统进化分析显示所有阳性株均为G4型。为了进一步研究该地区流行毒株的演化过程，以贝叶斯进化分析软件进行分歧时间估算，结果表明，藏猪流行毒株的分歧时间最早为1999年，最晚为2016年。并分别从每年的样本中挑选1份阳性样本得到全基因组序列，核酸序列相似性为89.5%~93.1%。通过对3条全基因组重组分析发现SWU/301/2019存在重组现象，SWU/301/2019重组区域位于ORF1的3 746—4 655 bp。本研究首次对四川地区藏猪源HEV进行调查，结果表明四川藏猪中存在一定程度的HEV感染，为四川地区对藏猪感染HEV的防治以及深入研究四川藏猪源HEV遗传变异及生物学特性提供了参考依据。

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《四川地区藏猪戊型肝炎病毒的检测和遗传演化分析》

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文件号：128062

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